グッピーは近親繁殖3世代で退化する場合があり、近親繁殖したグッピーは原始的な遺伝子が弱くなっていくからだ。3世代目に繁殖すると基本的に遺伝子は完全に消滅するので、グッピーが近親繁殖して3世代目になると退化することになります。遺伝子が退化して生まれた小魚は、体が比較的小さくなり、またグッピーの特徴が目立たなくなったり消えたりする。小さなグッピーの中には、病弱になったり、早死にしたりすることもある。
1、親魚を選択する:グッピーによい子孫を繁殖させるには、飼育者は適切な親魚を選択して交配する必要がある。親魚を選ぶ際には、まず近縁かどうかを気にする必要があり、近縁のグッピーから繁殖した子孫には遺伝子の退化が見られる。次に、外形的特徴に注意し、比較的特徴の近いグッピーを選ぶことで、子孫の遺伝子がより明らかになるという。最後に親魚の体が丈夫か、形が整っているかを観察する。
2、繁殖:グッピーが発情してからオスは母魚を追い続け、母魚がそれを受け入れると、それに合わせて交尾を行う。交尾に成功すると、卵はしばらく母魚の体内で発育し、卵が小魚になると生産が始まる。グッピーは卵胎生であるため、出産までの期間は比較的長くなり、飼育者は難産にならないように注意深く観察する必要がある。