精品グッピーと雑衣グッピーの最大の違いは品種が違うことで、精品グッピーは同じ品種のグッピーが繁殖したものなので。しかも同じ品種で繁殖すれば、尾の模様や体色が次世代に受け継がれる。
雑衣グッピーは違い、グッピーと他の魚を交配したものなので遺伝子が安定していない。優秀なグッピーよりも見栄えがよいものもあるが、繁殖の際に次世代への遺伝が完全に保証されているわけではない。比較的きれいな雑衣グッピーの中には、繁殖した子孫が劣る可能性があるものもある。観賞性に劣るガッチャグッピーもいますが、比較的きれいな子孫を繁殖させることができます。
プレミアムグッピーと雑衣グッピーは一緒に飼うことができますが、どちらも同じ品種に属し、環境への要求や習性が同じなので、一緒に飼うことができます。しかし、グッピーは純正な品種であり、雑多なグッピーは交雑したものであるため、混養する際には繁殖させないようにしている。さもなければ、優良グッピーの品種や、子孫の品質に影響を及ぼす可能性がある。発情期になった後、飼育者は彼らを分けて飼育する必要がある。