ゼブラフィッシュは水草にあまりこだわりがなく、飼育者が水草を選ぶ際には、ゼブラフィッシュの習性や見栄えによって決めることができます。飼育者が前景を設営したい場合は、ミニウシフェルトやローパール、モス水草などをチョイスしてみてはいかがでしょうか。これらの水草は背が低いが、観賞性が強く、前景に置いて見るのに適している。飼育者がミディアムビューを配置したい場合は、ミョウジュウやコクミズランなどの水草を選ぶとよい。この2種類の水草は環境に対する要求が高くなく、しかも比較的高いので、中景に配置するのに適している。飼育者が後景を設営したい場合は、ミドリギクやパゴダ、ルーバーなど体の大きな水草を選ぶといいでしょう。
ゼブラフィッシュには水草を食べる習慣がなく、また水草を植えることはゼブラフィッシュの成長に大きなメリットがあるため、ゼブラフィッシュは水草を入れたほうがいい。水草を植えることで、観賞性を高めることができるほか、酸素を発生させ、ゼブラフィッシュの成長と発育に有利になる。また、ゼブラフィッシュで代謝された物質は水草に吸収され、養分に変換されることもあります。これは水質改善に役立つだけでなく、水草の成長を良くすることにもつながる。
ゼブラフィッシュは水草を入れることができますが、飼育者も水槽内に水草を植えすぎることはできません。そうしないと、ゼブラフィッシュの活働空間が不十分になり、彼らの成長に影響を及ぼす可能性がある。