ワニ亀は水槽の中で深水養殖が可能で、彼らは深水の中で活働することが好きなので、しかも彼らの体力と水性はすべて比較的に良いので、また、深水の中で生存することができて彼らの背甲の発育が更に良いことをさせることができます。水槽の中で深水養殖することができます。しかし、ほとんどの水槽は長方形であり、成人してから体が大きくなるため、通常の長方形の水槽ではうまくターンできないため、飼育者は円形または正方形の水槽を使用した方が良いと考えられている。また、幼生のワニガメはあまり深い水中で飼育することはできない。体力や水泳能力が未発達なため、むやみに深い水中に放置すると、むせることや溺死する恐れがある。
ワニガメは魚と一緒に飼えませんが、性格は獰猛で肉食性のカメです。魚と一緒に飼っていると、魚を攻撃してくる可能性があります。底生類のカメで上位魚とはあまり衝突しないが、肺で呼吸をしており、定期的に水面に上がって呼吸をしているため、泳いでいる間に魚と衝突している可能性もある。