養魚の水の交換周期は一定ではなく、その大きさやかめの中のろ過状況の良し悪しによって、数日ごとに交換する場合もあれば、半月ごとに交換する場合もある。一般的に水槽が小さいほど、水を入れ替える頻度が高い。また、水の濁り具合にもよりますが、水質が澄んでいれば、水を替える必要はあまりありません。
交換水の大部分はやはり水道水を使って、川の水や井戸水は污染があるかもしれませんが、水道水は消毒した後、残留塩素を含んで、他の問題はありません。水道水に含まれる少量の塩素は、水を受けてから数日間干しておくのが一般的であり、このようにして眠くなった水が魚に害を及ぼさないようにすることを目的とする。
毎回交換する水の量はあまり多くなくて、一般的に総水の量の5分の1か4分の1で、交換しすぎると効果がなくて、交換するのが多くて魚体を刺激しやすくて、いくつかのストレス反応が発生します。しかし、皮の固い魚の場合は、水を少し多めに交換することもできますが、通常は3分の1を超えることはなく、これが水を交換する限界です。
もし水槽の中の魚が病気になったら、水の交換の状况を適切に調整しなければなりません。この時、水の中には大量の病原菌が含まれているので、できるだけ早くそれを取り除く必要があります。このときの水の入れ替えは、1日おきに行うのが一般的で、水量も適度に増やすと、魚体への刺激がかえって抵抗力を強め、病期を乗り切るのに役立つ。