生け簀養魚はどんな魚も水質を改善する作用を果たすことができなくて、結局魚はやはり水の中で排泄するのですが、一部濾過食性或いは草食性の魚は、水の中で過剰に繁殖した藻類及びその他の水生植物を掃除することができて、それによって水質を維持する効果を発揮して、例えばハクレン、コクレン、ソウギョなど。本当にいけすの環境を良くするには、やはり浄水能力のある植物を育てる必要があります。
1、草魚：草魚は通常は養う主要な魚類で、四大家魚の1つに属して、しかも数少ない草食性魚類です。我が国に広く分布しており、平原地帯の河川や湖沼に見られるが、普段は水域の中下層や水草の多い場所を好んで活動しており、気性は活発でスピードも速い。
2、ハクレン：ハクレンは上層魚であり、食性が濾過食であるため、他の魚との冲突はない。また、プランクトンや藻類を除去して水環境を改善する効果もあるが、経済的価値は高くなく、飼育すれば多く飼うのが一般的である。
3、コイ：コイは底生魚類に属し、我が国でも比較的によく見られる淡水魚である。底に生息しているため、水底に散らばった餌を食べて底質の悪化を避けることができ、いけすの環境にも一定のメリットがある上、飼育の難易度は高くない。
