真珠亀は深水亀ではありません。ミズガメであり、常に水の中に生息していますが。しかし、カミソリやジャコウガメが生息する水位と比べると、彼らが適応できる水位は特別深いとは言えないので、ディープウミガメとは言えない。真珠亀を人工養殖する場合は、体の大きさに合わせて水位の高さを決めるのがよい。
一般的に、幼少期の真珠亀は浅い水中で生活する必要があります。飼育者は水位の高さを背甲の高さに合わせる必要がある。体が大きくなるにつれて、飼育の水位も上げなければならない。彼らが成人してからは、水位の高さは背甲の高さの2−3倍に抑えることができるが、最高で3倍を超えてはならない。深い水の中で生活させたい場合は、干し台や緩やかな坂を用意しておくと、溺死やむせることが少なくなります。
真珠亀は比較的適応能力が高く、飼育しやすい。彼らは水質に対する要求も高くなく、水さえきれいで清ければ彼らはとてもよく生存することができます。飼育者は2~3日に1回、毎回半分の水を入れ替えればいい。アコガメは弱アルカリ性の水を好み、飼育者はPHを6.5-7.5の間に保つ必要がある。水質が酸すぎると体表を腐食させ、成長・発育に影響を及ぼす。