ヒメガメは長期間水の中にいることはお勧めできません。ヒメガメであり、水の中で休むことができますが、呼吸や繁殖は陸上で行う必要がありますので、ずっと水の中で生活していてはいけません。産卵だけでなく、定期的に水面に浮いてきて換気しなければなりません。
人工飼育されているヒメガメは、一般的に水体が小さく、水質污染の速度が速い。ヒメガメが長期間水中で生活していると、その背甲が細菌に感染する可能性が高い。条件が合えば、飼育者は彼らにひなたぼっこ台を作って、いつでもいつでも水面に浮いて休憩したり、ひなたぼっこをしたりできるようにしてあげることができます。
幼少期の炎亀は深水で養うことができません。生まれて間もないので、体力が弱く、体質が悪く、病気にも弱いので、深水で飼育すると、むせたり溺死したりする可能性が高くなります。飼育者は、水位を背甲より上か、ちょうど背甲を越えない程度に保つことが望ましい。
成体になってからは少し深い水で養うことができるが、水位も深すぎず、背甲の高さの1~2倍に抑えることができる。深い水で飼いたい場合は、干し台や緩やかな斜面を作って、素早く水面に上がって呼吸できるようにすることをお勧めします。