4~5センチの草亀は深水で飼うことはできません、草亀は深水の環境を受け入れることができますが、それらと純水亀とは大きな違いがあります、純水亀の呼吸、繁殖、採餌などはすべて水中で完成するので、草亀の呼吸、繁殖はすべて水を離れることで完成する必要があります。コガメは体力がなく、水位が深すぎると水面に浮上して呼吸することが難しいため、深い水で飼育するのは避けたほうがいい。飼育者が深い水で飼うには、かめの中に緩やかな傾斜や干し台を設けると、草亀は浅い水の中で足を踏み入れる場所があり、呼吸もしやすい。
4~5センチのクサガメは深い水で飼うのは不向きで、飼育者はその体型に応じて、飼育する水位の高さを決めることができる。一般的に水位の高さは腹甲より上に抑えることができ、むせることを避けることができます。水位を少し深めて、高さを背甲以上に抑えることもできますが、高さが背甲を超えすぎてはいけません。
また飼育者は容器内にひなた台を作り、その上で草亀が休憩したりひなたぼっこをしたりできるようにすることもできる。これによりむせることが少なくなるだけでなく、殺菌・消毒が可能となり、細菌感染を避けることができる。