ネズミ魚に砂を選ぶときは、粒の小さいものを選ぶとよいでしょう。大きさは1~2mmにしましょう。砂も少し丸みを帯びたものを選び、シャープなものは選ばないようにしましょう。ラットフィッシュは底辺での生活を好み、砂の中をもぐもぐするのが好きなので、あまり鋭い砂を使うと体表に傷をつけてしまう可能性が高いからだ。ネズミや魚も比較的水草が好きで、繊細な砂も水草の生息に適している。ねずみ水槽に敷く底砂は厚さに注意しなければならないが、底砂はあまり厚くなく、高さは1~2センチ程度でよい。
ネズミ魚は水槽の底部での活動を好むが、飼育する際には水槽の底部に細かい砂を敷くことで、安全で安定した空間を提供し、より安心感を与えることができる。底砂を敷いた後、飼育者は砂に細菌が繁殖しないようにろ過を強化する必要がある。さらに底砂の選択には、以下の点に注意する必要がある。
ラットフィッシュに底砂を選ぶには、まず砂の粒が大きすぎないようにしないとラットフィッシュを傷つけてしまうので注意しましょう。また、砂の性質にも注意し、水質に影響を与えてはならない。まとめて言うと、ラットフィッシュが入れやすい砂は、アメリカのシリコン砂やラットフィッシュ専用砂です。