ねずみ魚は2年ほど養殖すれば、繁殖できるが、それらが産卵・受精した後、飼育者が人工孵化する必要がある。ふ化の際には、飼育者が卵と親魚を分ける必要があり、卵が水槽や沈木にくっついている場合はストローで吸い出したり、くっついている場合はナイフで軽く削ったりする必要もある。卵が収集されると、飼育者は受精していない卵を選び出し、受精した卵を孵化かめに入れることができる。
ラット魚卵が孵化する際、飼育者は水温を24−26℃に保ち、水を中性に保つ必要があり、その間に少量の水交換を行い、水質を清潔に保つ。また、ふ化の間、飼育者は酸素を十分に保つ必要がある。魚卵は快適な環境で、約2~3日で孵化に成功する。
孵化に成功した小魚は、母体から運ばれたビテロキサンチンが吸収されていないため、最初の3日間は餌を与える必要はありません。飼育者は、彼らが自由に動き回るようになったら、豊年エビの卵や熟した卵黄などを与えてみることができる。
ネズミ魚の卵が孵化する時間は多くの要素の影響を受けて、影響力が比較的大きいのは水温で、水温が高いほど孵化の時間が速い。しかし水温は最高で26℃を超えないようにしないと孵化率にも影響する。また、水質や溶存酸素量はふ化の時期にも影響するので、飼育者は特に注意したほうがよい。