グッピーは混養することができます。適切な魚と交配すれば、異なる品種のグッピーが生まれる可能性がある。しかし、交配を誤るとグッピーから奇形の胎児が生まれる。また、串刺しは子孫の遺伝子に影響を及ぼすため、飼育者がグッピーを繁殖させるためには、他の魚と混養しないほうがよい。
グッピーは他の魚と串に刺すだけでなく、異なる種類のグッピーと串に刺すこともある。グッピーは品種が多いため、異なる品種のグッピーを交配した場合、新たな品種が生まれる可能性が高い。しかし、飼育者がグッピーに高純度度の遺伝子を保持させたいのであれば、異なる品種のグッピーを一緒に混養することはできない。
1、グッピーの性格は温和で、飼育者は混養する時に性格が似ているものを選ぶ必要があり、性格が獰猛なものを選ぶことはできなくて、さもなくばグッピーは傷つきやすい。
2、混養の際には消毒に注意し、病原菌が入った魚を水槽内に入れないようにし、水質を污染したり、他の魚に感染させたりしないようにする。
3、グッピーの大きさは大きくないが、飼育者も飼育密度に注意し、飼育密度が高い場合はフィルターや酸素ポンプを装着する必要がある。