グッピーが発情すると、雌の腹部は次第に膨らんで黒い胎斑が現れる。オスはメスを追い続け、メスの漏殖孔に受け渡し器を差し込んで精子を排出し、体内受精を行う。雌は後で受精するために精子を蓄えることができる。妊娠した雌は尻びれと腹びれの間に黒い三役の塊があるのが特徴。
グッピーは受精後約1ヶ月程度で赤ちゃんを産むことができ、期間は比較的短い。一般的にグッピーの繁殖の間隔は25日から30日程度とされている。グッピーの雌は、生産される頃にはいくつかの特徴を持つだろう。例えば、出産する雌の下腹部には黒い斑点がある。しかも彼らは特にバランスを崩して泳ぎ、酒に酔っているかのようによろよろしている。このような特徴から、メスがすぐに出産するかどうかを判断することができる。