草亀は半水棲、半陸生性の爬虫類に属し、主に湖、河川、池などの水域付近に生息する。クサガメの養殖には水が欠かせないことに注意しなければならないが、ガラス製のシリンダーに水を入れすぎてはいけない。クサガメは肺呼吸で、水中を泳ぐ際には頭を水面より上に出して呼吸するため、かめの中の水がクサガメの頭を越えないようにしないと溺れてしまう恐れがある。
かめの水位がかめの甲羅を越えていない場合は、かめの底に石を置いて、うつぶせにして休ませると、日光浴がしやすくなります。子ガメを飼う場合は、ガメの四肢を越えず、甲羅の一部が浅く露出する程度の水位が望ましい。大人のカメなら甲羅を1センチほど超える水位にすることができる。
草亀は水質に対する要求が高く、常にガラスのシリンダー内の水を交換し、シリンダー内の水の清潔を保つ必要があります。それらに水を入れ替える頻度は季節に関係している。通常であれば、7~10日おきに水を交換すればよいが、水質要求が高いので、暑い日には、3~5日に1回の頻度で水を交換することができ、適切な頻度で水を交換することができる。
一方、水温が15℃を下回ると、草亀は冬眠に入ります。このときの水の交換頻度は遅くして、月に1~2回程度でOKです。水を入れ替えるときは、一度に水を入れ替えるのではなく、毎回シリンダー内の水量の三分の一か四分の一だけを抜いて、同じ量の新しい水を入れればよいので注意してください。飼育している水はシリンダーに入る前に2日前に日干しして、水の中の塩素を除去しなければならない。