水槽の中の濾過装置の作用は水中の糞便などの汚物を除去し、水体を清潔に保ち、酸素を十分に保ち、魚にきれいな環境を提供することにある。グッピーを飼育する水槽が小さいと水質の汚染速度が速くなり、フィルターを使うことで汚染速度を緩めることができます。これで水換えがそんなに頻繁でなくても、魚は普通に生活できます。この場合、濾過装置を設置していないと、水質が濁っていて、主人が水を取り替えるのを忘れてしまうと、魚は病気になりやすい。しかし、養殖された水槽の体積が非常に大きいと、水質が悪くなるのはそれほど速くない。定期的に水を入れ替えさえすれば、水質はずっときれいに保たれます。この場合、フィルタ装置を設置する必要はない。
グッピーは体が小さいので、濾過孔が大きすぎる濾過装置を選ぶことができません。また、水の流れが激しい環境で生活するのは好きではないので、中小型の濾過装置を選んだほうがいいです。滝の濾過、水の妖精、外掛け式のマイクロフィルターカートリッジなどがあります。中でも、水妖精は比較的多く使われているフィルターです。大きな水流を起こさず、掃除がしやすく、クジャクに必要な浄水効果を得ることができます。また、水妖精は硝化細菌の生存の場を提供することができる。硝化細菌も水質を適切に清潔にし、酸素を供給することができ、グッピーにとって非常に重要である。そのため，グッピー飼育のためのろ過装置として水妖精を使用することが推奨されている。
