羅漢魚腸炎は、与えられた餌が不潔であることが原因である可能性があり、特に生きた餌を与えた場合、餌に寄生虫や細菌がついていることが多く、羅漢魚の腸炎が起こりやすくなる。
不適切な餌やりの可能性もあり、多くの飼育者は羅漢魚の頭を刺激するために飢餓法を使用していますが、不規則な食事が続くと羅漢魚の胃腸炎を引き起こすことがあります。栄養を確保するために大量の餌を与えていることもあり、羅漢魚の消化器系に負担がかかり、そのうち腸炎を起こしてしまうこともあります。
治療羅漢魚の比較的に効果的な薬物はハロペリン、ペニシリン、テリンなどであり、腸炎は細菌感染或いは腸の炎症であるため、治療の薬物の中に殺菌、静菌及び消炎の機能があり、すべて有効な腸炎を治療することができる。これらの薬は、羅漢魚の餌に混ぜたり、水に溶かして病気の魚を薬浴させたりすることができる。病状によって、使用する薬や薬の量が異なります。
前段階であれば、ハロペリン酸を少し投与した後、水温を30~32℃の間に上げておくと、約2~3日で腸炎が治ります。中期になればペニシリンを使用する必要があり、100キロの水に800万単位のペニシリンを3本入れた割合で羅漢魚を薬浴し、毎日10-20分薬浴することができる。治療の間は毎日水を入れ替え、餌やりもやめる。後期の比較的重症の場合には、50リットルの水に40錠のペリトリンを加えて薬浴治療を行うように、薬の交換と増量が必要である。