羅漢魚の雄雌の明らかな特徴は外形と性格であり、飼育者は以下の点の区別によって判断することができる:
まず外形であり、羅漢魚の雌の背びれの棘条は平たくて細かいが、雄の背びれの棘条は太くて丸みがある。次にオスの胸が丸みを帯びていて、体と平行に見えること。母魚の胸は少し尖っていて、少し突き出ている感じがします。さらに体つきですが、オスの体は太く、メスの体は比較的細くなっています。最後に生殖孔があるが、雄の生殖孔はV字型、雌の生殖孔はU字型であり、発情時に生殖孔の違いがはっきりする。
飼育者は性格で判断することもできますが、一般的にオスは活発な性格で、エサを奪うときにも積極的で、驚いたりもしにくいと言われています。メスは相対的に肝が小さく、攻撃力はオスに劣る。
羅漢魚の雄雌は一緒に飼わないほうがいい。羅漢魚の性格は獰猛で、他の魚を攻撃するのが好きだからだ。特に同類の間では、縄張り争いでけんかになることがよくある。羅漢魚は攻撃力が強く、ケンカをしたときのケガが大きいため、飼育者は雄雌を一緒に飼わないほうがいい。もし羅漢が繁殖期になったら、飼育者が一緒に飼ってみて、平和に共存できれば繁殖が可能になる。平和的に共存できないのであれば、直ちに隔離したほうがいい。