小魚がポンプに吸い取られないようにするには、入水口のところにストッキングをかぶせて魚が通らないようにします。通常ポンプの流量は厳密に制御しなければならず、流量が小さすぎてろ過の目的に当たらない。しかし、流量が多いと魚が泳ぎ疲れてしまうこともあります。通常、ポンプの流量は水槽の大きさと関係があり、すべての水が1時間に7~10回循環することを保証しなければなりません。
1、ろ過を助ける：ポンプの第一の役割はろ過を助けることです。ろ過はカートリッジだけでは何の役にも立たないが、ポンプがあって初めて水が流れてくる。水流はフィルターボックスに入り、フィルター材の層を通過してから、その中の不純物が除去される。
2、活働を促進する：ろ過に有利なほか、ポンプは魚の活働を促進することができて、流れてきた水は魚が泳いでいる過程の中で一定の抵抗を生むことができて、それによって更によく活働を行うことができて、魚の健康にもとても役に立つことができます。
3、水質維持：ろ過を助ける水質維持作用もあるが、ポンプによる水流は死水を活性化させ、好気性細菌もその環境を利用して増殖を開始し、シリンダー内の硝化システムを整備する。硝化システムがよくなってこそ、シリンダー内の水は頻繁に入れ替える必要がない。
