豚鼻亀は他のカメと同じで、すべて卵生動物である。原産地では通常、7~10月に繁殖が始まる。ブタガメは水中で交尾してしばらくすると雌が岸に上がってくるが、多くは夜を選んで卵を産む。卵を産む前に適当な場所を選び、爪で深さ約20センチの穴を掘って、そこに卵を直接産み付ける。産卵が終わるとそばの土で卵をかぶせることもある。1度に7~19個の卵を産むことができ、産卵前はほとんどのカメと比較的似ているが、卵の孵化は他のカメとは一定の違いがある。彼らの胚は成熟した後、卵内で休眠を続け、大雨や洪水に遭遇するまで水中で殻を破って外に出ることができないからだ。だからブタ鼻ガメのふ化時期は、その土地の気候と大きく関係している。
豚鼻亀は人工繁殖ができるが、人工繁殖の難度は比較的に高く、人工養殖は完全に原産地の環境を模擬することができないためで、しかもそれらは一般的にいずれも卵を乾季の砂州に産することができて、しかも水に浸してから孵化する必要がある。原産地の気候は独特で、それらの卵はまだ一定期間の延滞期間を経なければならないため、人工ふ化でこれらの環境をシミュレートするのは難しい。