グッピーを養殖する時、雄魚と母魚が混養できるかどうかに注意する必要がある。大人のグッピーは雄と雌を別々に飼うことができる。しかし、孵化したばかりで、まだ1ヶ月も経っていない小魚にとっては、雄母は区別できない。だから、幼魚の段階では一緒に飼うことができますが、養殖して1ヶ月後、つまり雄母を区別できるようになってから、別々に養殖することができます。
もし一緒に飼っていると，繁殖季節になると雄が雌を追いかけ，自然繁殖していく。ただし、年齢が性成熟に達したばかりのグッピーにとっては、繁殖を行う効果が非常に悪く、繁殖した小魚の品質が非常に悪いことに注意する必要がある。なので、別々に飼った方が無難です。
グッピーを養殖するときに雄魚と母魚を分離飼育すると、メリットが多い。まず、性成熟年齢に達したばかりのときに繁殖しないようにすることです。それらを分け、最適な年齢になってから繁殖することで、品種を改良し、繁殖の効果を高めることができます。この面以外にもいくつかのメリットがあります。例えば、別々に養殖すると、雄の魚はもっと速く成長し、雌の魚もよく発育し、周りの環境要因もコントロールしやすくなります。また、オスはメスに比べて性格が悪いので、別々に飼うことでメスの被害を防ぐことができます。
