魚は水の中で生活していますが、呼吸するためにも酸素を必要とします。酸素は新陳代謝の重要な物質ですから、魚にとって欠かせません。ちなみに、魚類の呼吸器官はエラであるが、エラは空気中でくっつくため、呼吸の効果が大きく弱まるため、離水後の魚はほとんどが酸欠で死に、水中でしか正常に呼吸できない。
1、魚の浮袋:魚の浮袋は硬骨魚の器官で、その作用は気体を調節して、それによって自分の密度を変えて、魚が浮上したり潜ることができます。しかし、アフリカの肺魚の場合、その浮袋の構造は肺と似ていて、酸素を貯蔵して魚の呼吸を助けることができます。
2、皮膚:ムツゴロウは皮膚と口の粘膜の呼吸作用で酸素を取り込むことができる。この魚は小型の底魚で、干潮時に陸に上がって生活することができ、強力な胸筋柄の力を借りて干潟を跳躍して餌を探すことができる。
3、腸:ドジョウの場合、えらで呼吸できるほか、空気中で腸で呼吸することもできる。川や湖、池沼などで見られるこの魚は、普段は水底に生息していますが、水源が干上がると泥の中にもぐり込み、土の中にわずかな水分があれば死んでしまうことはありません。