1、浮遊性飼料:中層または上層で活動する三湖慈鯛を飼っている場合、最も適したのは浮遊性飼料である。この飼料は水に投入すると水面に漂い、魚は自分で採食することができる。
2、沈底飼料:この飼料は水中に投入すると上に漂わず、逆にすぐに水底に沈み、主に岩栖類と地層魚のために準備される。
3、薄切り飼料:薄切り飼料は上の2つの飼料の特性を兼ね備えており、最初は浮遊し、後で底に沈むが、一般の養殖者にとっては薄切りの効果はよくなく、中上層の魚が食べすぎて下層の魚が食べられないことが多い。
三湖慈鯛に動物性飼料を与えるのも良いですが、念のため生餌を直接与えず冷凍処理するのが一般的です。よく見られる飼料には南極エビ、赤虫、糸ミミズ、豊年エビなどがある。冷凍すると保存しやすいだけでなく、細菌感染による魚の病気も避けることができます。
三湖慈鯛は雑食性のものが多いが、蝶類のような菜食性のものも少なくない。これらの魚は胃腸が弱いので、一般的に専門の菜食プラスチックを用意しなければならない。アリシン、ベリー、顆粒の主食で調製し、1:1:1の割合で混合して菜食シートを作って飼育することができる。