グッピーの生存能力はとても強くて、遺伝子もとても強いです。近縁繁殖ができるので、同じ巣のクジャクは交配繁殖することができます。しかし、どんなに良い遺伝子であっても。近親交配の回数が多すぎると、子孫が退化する問題もあります。3世代以内に交配した子孫であれば、退化現象はそれほど深刻ではない。子孫は正常に成長発育し、子孫の繁殖を続けることができる。
ただし、第三世代を超えると、再び近親交配が行われる。彼らが産んだ魚は病気になりやすいか、正常に発育できない。ひどい時には生まれたばかりで死産になることがあります。そのため、同巣で繁殖するグッピーは最大3世代以内に抑えられる。
グッピーの系統は多く、その中に交雑による品種がある。強い繁殖力を持ち、品種が違っても繁殖交配が可能です。串種することで、それらの形態、体色を変えることができます。異なる品種のグッピーが混養され、繁殖した子孫はそれぞれ異なる。小魚は柄も色も親魚とは違い、ほとんど1匹ずつ姿が違います。しかし、人工干渉の場合にのみ、シリアル交配が行われます。
