水槽の中に魚があれば、消毒するには二酸化塩素が一般的です。この薬は殺菌力が強く、非常に低い濃度でも病気を治す細菌を退治することができます。これを水に溶かした後、濃度を1リットルあたり0.5~1ミリグラム程度に保つには、1分で99%の細菌を殺すことができます。このほか過マンガン酸カリウムで消毒することもできますが、殺菌効果は比較的低いです。
1、シリンダーを開けて消毒する：買ったばかりの新しい水槽は直接魚を飼うことができなくて、先にシリンダーを開けて、シリンダーを開ける第一歩は消毒である。水槽を置いたら、中に水をいっぱい入れて、過マンガン酸カリウムを入れて浸します。通常は3~4時間走って、水を捨てます。倒れた後、薬が残らないように、水で洗い流さなければなりません。
2、生餌消毒：魚に生餌を与える場合は、生餌に細菌や寄生虫がついて魚が感染して病気にならないように消毒する必要があります。消毒の方法は、まず浄水で1週間ほど養生してから、塩でワクチンをやることで、一部の菌を死滅させることができます。また、凍らせることで殺菌もできます。
3、魚体消毒：魚体を消毒する薬はたくさんあります。よくある過マンガン酸カリウムのほかに、チモムシ、硫酸銅、硫酸第一鉄などを選んで、一定の割合で専門のシリンダーに入れて、魚をすくって、中に入れて10~20分ぐらい浸して洗います。
